1992 yılında kurulan üniversite bünyesinde 11 fakülte, 5 enstitü, 5 yüksekokul ve 16 MYO yer almaktadır.
Fakülteler
- Denizcilik Fakültesi
- Eğitim Fakültesi
- Fen Edebiyat Fakültesi
- Güzel Sanatlar Fakültesi
- İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- Bandırma İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi
- İlahiyat Fakültesi
- Mühendislik Mimarlık Fakültesi
- Tıp Fakültesi
- Turizm Fakültesi
- Veteriner Fakültesi
Yüksekokullar
- Beden Eğitimi ve Spor Yüksekokulu
- Sağlık Yüksekokulu
- Bandırma Sağlık Yüksekokulu
- Yabancı Diller Yüksekokulu
- Uygulamalı Bilimler Yüksekokulu
